File:Lake Gosciaz pollen giagram.svg

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Summary[edit]

Description
English: Lake Gosciaz Late glacial and holocene pollen diagram
Date
Source Own work
Author Merikanto

Source of data is European Pollen database

Complete name : Lake Gosciaz Acronym : GOSCI187 Country : Poland

Source of the data : Ralska-Jasiewiczowa Magdalena Latitude : 52°35'0" N Longitude : 19°21'0" E Elevation : 64m

References : 

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Age_BP;Lycopodium (counted);Pinus;Betula;Alnus;Carpinus betulus;Corylus avellana;Quercus;Juniperus communis;Gramineae;Ulmus;Secale cereale;Artemisia;Carex-type;Cyperaceae;Betula nana-type;Others -35;253;534;169;150;10;15;32;6;134;1;73;16;4;5;0;185.0 -30;170;351;123;120;8;19;43;32;152;4;89;18;9;10;0;213.0 -20;300;493;164;139;2;17;52;5;142;5;79;18;2;5;0;187.0 -10;572;428;245;189;6;17;47;14;139;5;93;19;11;8;0;238.0 0;138;454;154;161;4;8;39;14;136;4;81;21;8;5;0;238.0 10;461;392;113;107;4;10;32;24;113;3;129;7;10;4;0;236.0 25;650;503;74;96;4;9;28;39;93;2;130;5;2;4;0;165.0 42;615;534;120;48;5;4;22;16;76;1;93;10;5;8;0;155.0 65;693;555;149;107;13;13;47;18;73;2;74;11;4;4;0;135.0 89;639;567;123;55;6;18;36;13;114;0;64;11;3;3;0;172.0 111;421;517;119;80;3;12;65;9;104;0;44;9;5;5;0;152.0 134;411;597;132;110;6;37;86;10;88;2;50;16;10;2;0;202.0 190;271;654;136;135;17;44;81;7;97;3;24;11;7;4;0;249.0 275;375;420;133;156;20;36;152;4;86;0;48;12;6;9;0;233.0 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12502;669;268;243;0;0;0;0;37;42;0;0;13;15;14;10;31.0 12520;700;589;143;1;0;0;0;69;87;0;0;59;38;35;8;63.0 12533;1047;394;90;0;0;0;0;76;79;0;0;98;21;24;16;79.0 12552;791;437;342;0;0;0;0;80;30;0;0;39;20;3;6;57.0 12564;973;391;147;1;0;0;0;113;87;0;0;84;37;31;23;106.0 12580;495;411;242;0;0;0;1;64;79;1;0;72;57;19;15;79.0 12581;376;462;226;3;1;1;1;14;72;1;0;28;20;9;14;64.0 12582;820;533;241;0;0;0;1;32;97;0;0;30;27;7;12;101.0 12583;1240;548;240;2;0;1;0;22;87;1;0;21;9;11;2;75.0 12584;640;506;295;2;0;0;2;22;80;0;0;32;21;6;23;72.0 12585;339;446;209;0;0;0;2;31;73;0;0;19;12;31;8;67.0 12586;682;555;263;2;0;0;0;24;80;1;0;19;27;8;9;76.0 12587;601;312;138;0;0;0;1;107;63;0;0;10;7;16;3;46.0 12590;252;637;287;1;0;0;0;112;109;0;0;46;24;29;4;110.0 12593;580;559;276;0;0;0;0;101;91;0;0;73;82;13;11;93.0 12623;698;373;119;1;0;0;0;3;62;0;0;26;19;28;9;48.0 12635;645;527;285;0;0;0;0;34;77;1;0;38;22;22;22;75.0 12659;2070;288;71;0;0;0;1;3;29;0;0;31;11;11;4;44.0 12665;939;647;206;0;0;0;1;7;49;0;0;23;0;42;27;63.0 12690;597;411;295;0;0;0;0;2;33;1;0;15;6;20;9;52.0 12721;407;684;246;0;0;0;0;4;37;0;0;15;23;11;11;55.0 12739;487;425;290;1;0;0;0;2;36;0;0;9;11;10;3;37.0 12751;685;550;475;0;0;0;0;6;84;1;0;13;10;11;21;79.0 12782;357;367;459;0;0;0;0;7;54;4;0;6;14;3;20;73.0 12788;359;437;312;1;0;0;0;4;37;0;0;11;4;13;5;56.0 12812;226;575;372;0;0;0;1;8;51;2;0;10;25;10;6;49.0

Gnuplot script to draw this image

    2. gnuplot 16 curves in one image
    3. many area curve diagrams
    4. semicolon separated pollen data file
    5. to pdf
    7. WIP 0001, 2017.2
    1. input file is like this
  2. Age_BP;Corylus;Betula;Pinus;Gramineae;Pediastrum;Salix;Artemisia;Cyperaceae;Juniperus;Potamogeton;Helianthemum;Thalictrum;Filicopsida #monolete undiff.;Compositae subf. Asteroideae;Filipendula;Others
  3. 10583;395;92;100;12;2;4;0;3;0;1;0;1;23;0;5;23.0
  4. 10633;300;177;164;12;0;10;3;6;0;0;0;0;16;0;10;24.0
  5. 10684;246;300;116;11;1;3;7;4;0;0;0;0;14;0;4;16.0
  6. 10725;207;253;123;12;2;5;3;4;0;0;0;0;23;0;2;26.0
  7. ...

kaption="Lake Gosciaz, Poland" filee="gosciez_p15.txt" outbase="lake_gosciaz_poland_pollen_diagram"

  1. kaption=$3
  2. outbase=$2
  3. filee=$1

outgp=$outbase".gp" outpdf=$outbase".pdf" outsvg=$outbase".svg"

timee1="$(awk -F ";" 'NR==2{print $1}' $filee)" timee2="$(awk -F ";" 'END {print $1}' $filee)"

timesi=$timee2":"$timee1

echo $timesi

rm $outgp rm $outpdf rm $outsvg

  1. echo "set terminal pdf size 30,110" >> $outgp

echo "set terminal pdf size 40,100" >> $outgp

echo "" >> $outgp echo "set datafile separator ';' " >> $outgp echo "set output \"$outpdf\"" >> $outgp echo "" >> $outgp

  1. echo "set size ratio 0.2" >> $outgp

echo "" >> $outgp

  1. echo "set multiplot title \"{/:Bold=60 "$caption"}\" ">> $outgp

echo "set multiplot ">> $outgp echo "" >> $outgp echo "" >> $outgp

echo "set key off" >> $outgp

echo "" >> $outgp echo "" >> $outgp

echo "paddington=40" >> $outgp echo "ykoeff=12000" >> $outgp echo "ay=0.01" >> $outgp echo "y=ay" >> $outgp echo "ysiz=0.2" >> $outgp

set taxafontsize = 50

echo "" >> $outgp echo "" >> $outgp

colu=17 taxa=" $(awk -v f=$colu -F ";" 'NR==1{print $f}' $filee)" echo "# bottom col" >> $outgp echo "set table '/dev/null'" >> $outgp echo "set origin 0,y" >> $outgp echo "set size 0.95,ysiz" >> $outgp echo "plot '"$filee"' u 1:17 w lines linecolor 'white'" >> $outgp echo "min_y = GPVAL_DATA_Y_MIN" >> $outgp echo "max_y = GPVAL_DATA_Y_MAX" >> $outgp

echo "unset table" >> $outgp

echo "" >> $outgp echo "set label "$colu"\" "$taxa"\" at graph 0.25,0.9 center font \"Arial,100\" " >> $outgp

  1. echo "set title \""$taxa"\" font \",60\" " >> $outgp
  2. echo "ysiz=max_y/ykoeff" >> $outgp

echo "rundi=(floor(max_y/100.0)*100.0)+100.0" >> $outgp echo "ysiz=(rundi+paddington)/ykoeff" >> $outgp echo "set xrange ["$timesi"]" >> $outgp echo "set origin 0.02,y" >> $outgp echo "set ytics 100 font \",45\" " >> $outgp echo "set xtics font \",80\" offset 0,graph -0.05 " >> $outgp echo "set xlabel \"Age BP\" font \",80\" " >> $outgp echo "set size 0.95,ysiz" >> $outgp echo "set ylabel \"Count\" font \",35\" " >> $outgp echo "plot '"$filee"' u 1:17 w filledcurve x1 linecolor '#005f00'" >> $outgp echo "unset label" >> $outgp

for (( colu=3; colu<17; colu++ )) do echo "" >> $outgp echo "" >> $outgp echo "y=y+ysiz+0.01" >> $outgp

taxa=" $(awk -v f=$colu -F ";" 'NR==1{print $f}' $filee)"

  1. echo $taxa
  1. colu=17

taxa=" $(awk -v f=$colu -F ";" 'NR==1{print $f}' $filee)" echo "# bottom col" >> $outgp echo "set table '/dev/null'" >> $outgp echo "set origin 0.02,y" >> $outgp echo "set size 0.95,ysiz" >> $outgp echo "plot '"$filee"' u 1:"$colu" w lines linecolor 'white'" >> $outgp echo "min_y = GPVAL_DATA_Y_MIN" >> $outgp echo "max_y = GPVAL_DATA_Y_MAX" >> $outgp

echo "unset table" >> $outgp echo "" >> $outgp echo "set label "$colu"\" "$taxa"\" at graph 0.25,0.9 center font \"Arial,100\" " >> $outgp echo "set xrange ["$timesi"]" >> $outgp

  1. echo "set title \""$taxa"\" font \",60\" " >> $outgp
  2. echo "ysiz=(max_y/ykoeff)" >> $outgp

echo "rundi=(floor(max_y/100.0)*100.0)+100.0" >> $outgp echo "ysiz=(rundi+paddington)/ykoeff" >> $outgp echo "set origin 0.02,y" >> $outgp

  1. echo "set ytics 100 font \",45\" " >> $outgp
  2. echo "set xtics format \" \" " >> $outgp
  3. echo "set xtics font \",40\" " >> $outgp

echo "set xtics format \" \" " >> $outgp echo "set xlabel \" \" " >> $outgp echo "set bmargin 3" >> $outgp echo "set size 0.95,ysiz" >> $outgp echo "set ylabel \"Count\" font \",35\" " >> $outgp echo "plot '"$filee"' u 1:"$colu" w filledcurve x1 linecolor '#005f00'" >> $outgp echo "unset label" >> $outgp

done

echo "y=ysiz+y+0.01" >> $outgp

colu=2 taxa=" $(awk -v f=$colu -F ";" 'NR==1{print $f}' $filee)" echo "# bottom col" >> $outgp echo "set table '/dev/null'" >> $outgp echo "set origin 0.02,y" >> $outgp echo "set size 0.95,ysiz" >> $outgp echo "plot '"$filee"' u 1:2 w lines linecolor 'white'" >> $outgp echo "min_y = GPVAL_DATA_Y_MIN" >> $outgp echo "max_y = GPVAL_DATA_Y_MAX" >> $outgp

echo "unset table" >> $outgp

echo "set label \" "$kaption"\" at graph 0.5,1.2 center font \"Arial,150\" " >> $outgp

echo "" >> $outgp echo "set label "$colu"\" "$taxa"\" at graph 0.25,0.9 center font \"Arial,100\" " >> $outgp

  1. echo "set title \""$taxa"\" font \",60\" " >> $outgp
  2. echo "ysiz=max_y/ykoeff" >> $outgp

echo "rundi=(floor(max_y/100.0)*100.0)+100.0" >> $outgp echo "ysiz=(rundi+paddington)/ykoeff" >> $outgp echo "set xrange ["$timesi"]" >> $outgp echo "set bmargin 3" >> $outgp echo "set origin 0.02,y" >> $outgp echo "set ytics 100 font \",45\" " >> $outgp echo "set x2tics font \",80\" offset 0,graph -0.05 " >> $outgp echo "set x2label \"Age BP\" font \",80\" " >> $outgp echo "set size 0.95,ysiz" >> $outgp echo "set ylabel \"Count\" font \",35\" " >> $outgp echo "plot '"$filee"' u 1:2 w filledcurve x1 linecolor '#005f00'" >> $outgp

echo "unset label" >> $outgp

gnuplot $outgp pdf2svg $outpdf $outsvg

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current19:56, 23 February 2017Thumbnail for version as of 19:56, 23 February 20173,600 × 9,000 (452 KB)Merikanto (talk | contribs)Name of lake
19:54, 23 February 2017Thumbnail for version as of 19:54, 23 February 20173,600 × 9,000 (452 KB)Merikanto (talk | contribs)User created page with UploadWizard

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