File:Reverse transcription.svg
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Beschreibung[Bearbeiten]
BeschreibungReverse transcription.svg |
English: Mechanism of reverse transcription in class VI virus ssRNA-RT, human immunodeficiency virus (HIV). Key: U3 - promoter region, U5 - recognition site for viral integrase; PBS - primer binding site; PP - polypurine section (polypurine tract); gag, pol, env - see HIV genome organisation). Colors mark complementary sequences. This diagram isn't drawn to scale. Reverse transcription occurs in the cytoplasm of host cell. In this process, viral ssRNA is transcribed by the viral reverse transcriptase (RT) into double stranded DNA. Reverse transcription takes place in 5'→3' direction. tRNA ("cloverleaf") hybridizes to PBS and provides -OH group for initiation of reverse transcription. 1) Strong stop complementary DNA (cDNA) is formed. 2) Template in RNA:DNA hybrid is degraded by RNase H domain of reverse transcriptase 3) DNA:tRNA is transferred to the 3'-end of the template (synthesis "jumps"). 4) First strand synthesis takes place. 5) The rest of viral ssRNA is degraded by RNase H, except for PP site. 6) Synthesis of second strand of ssDNA is initiated from the 3'-end of the template. tRNA is necessary to synthesis of complementary PBS 7) tRNA is degraded 8) After another "jump", PBS from the second strand hybridizes with the complementary PBS on the first strand. 9) Synthesis of both strands is completed by the DNAP function of reverse transcriptase. Both dsDNA ends have U3-R-U5 sequences, so called long terminal repeat sequences (3'LTR and 5'LTR, respectively). LTRs mediate integration of the retroviral DNA into another region of the host genome. Sources: Alan Cann: Principles of molecular virology. Amsterdam: Elsevier Academic Press, 2005, p. 93 ISBN 0-12-088787-8.; en:Reverse transcription entry in Wikipedia. Polski: Mechanizm odwrotnej transkrypcji u wirusów klasy VI ssRNA-RT, na przykładzie ludzkiego wirusa niedoboru odporności (HIV). Oznaczenia: U3 - region promotorowy; U5 - miejsce rozpoznawane przez wirusową integrazę; PBS - miejsce wiążące primer PP - sekwencja polipurynowa; gag, pol, env - zobacz organizacja genomu wirusa HIV). Dobór kolorów wskazuje na sekwencje komplementarne. Diagram nie jest narysowany w skali. Odwrotna transkrypcja wirusa HIV odbywa się w cytoplazmie komórek gospodarza. W tym procesie wirusowe jednoniciowe RNA (ss RNA) jest przepisywane przez odwrotną transkryptazę (RT) na dwuniciowy DNA. Odwrotna transkrypcja odbywa się w kierunku 3'→5'. tRNA ("listek koniczyny") wiąże się do PBS i dostarcza grupy hydroksylowej (-OH) niezbędnej do inicjacji odwrotnej transkrypcji. 1) Powstaje kompementarny DNA (cDNA). 2) Matryca RNA w kompleksie RNA:DNA jest rozkładana przez RNazową H domenę odwrotnej transryptazy 3) Kompleks DNA:tRNA zostaje przeniesiony na 3'-koniec matrycy (synteza "przeskakuje" na drugi koniec). 4) Odbywa się synteza pierwszej nici DNA. 5) Pozostała część matrycy ssRNA jest degradowana przez RNazę H, za wyjątkiem sekwencji polipurynowej (miejsca PP). 6) Następuje inicjacja syntezy drugiej nici ssDNA , począwszy od końca 3' matrycy. tRNA jest niezbędny do syntezy komplementarnej PBS 7) tRNA dysocjuje od DNA i ulega rozłożeniu przez RNazę 8) Po kolejnym "skoku" PBS z drugiej nici hybrydyzuje z komplementarnym PBS pierwszej nici ssDNA. 9) Dzięki aktywności polimerazy DNA (DNAP) odwrotnej transkryptazy, powstają brakujące fragmenty obu nici dsDNA. Na obu końcach dsDNA znajduje się sekwencja U3-R-U5, tzw. sekwencje LTR (na 3' i 5' końcu odpowiednio, 3'LTR i 5'LTR). LTR odpowiadają za integrację wirusowego DNA do genomu komórki gospodarza |
Datum | |
Quelle | Eigenes Werk |
Urheber |
Filip em Diese W3C-unbestimmte Vektorgrafik wurde mit Inkscape erstellt . |
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English: This image was created as part of the Philip Greenspun illustration project.
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aktuell | 14:05, 12. Sep. 2008 | 748 × 1.284 (477 KB) | Filip em (Diskussion | Beiträge) | {{Information |Description= |Source= |Date= |Author= |Permission= |other_versions= }} | |
11:33, 12. Sep. 2008 | 737 × 1.334 (454 KB) | Filip em (Diskussion | Beiträge) | {{Information |Description={{en|1=Reverse transcription}} |Source=own work |Author=Filip em |Date=2008 |Permission= |other_versions= }} <!--{{ImageUpload|full}}--> |
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