File:Intergen51 fc40 bacilli.png

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Description

Projet de recherche: Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes. L'étude des intercalaires cds..cds permet de les comparer aux intercalaires cds..RNA et RNA..RNA. Les diagrammes des fréquences des intercalaires cds..cds positifs continus de 1 à 40 pbs sont présentés ici regroupés en clade. Ce regroupement est utilisé dans la comparaison entre les diagrammes continus et discontinus au chapitre correspondant. Les étiquettes représententent les fréquences multiples de 6.

Les abscisses sont les fréquences unitaires et les ordonnées leurs effectifs. La courbe de tendance est un polynôme de d°12 (poly 12) représentée par son coefficient de détermination R2. Y est ajouté l'effectif du diagramme (diagr).
Le calcul de l'intercalaire est fait méthodiquement sur le tableur calc de LibreOfiice.
Voir la construction de ces diagrammes dans la page de chaque génome xxx intergen51 où xxx est le code KEGG [1]. Cette page présente
- le gènome en détail dont le lien à la source des donnée NCBI,
- permet de retrouver les 2 colonnes du diagramme dans les données intercalaires
- et présente les courbes de tendances sous forme de plynômes de d°3 dans les diagrammes CDS-CDS positifs.
Les liens à ces pages sont     ban    bsu    lam    lbu    lmo    pmq    ppm    ppmp.
Date 27.01.23
Source Own work
Author Mekkiwik

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current09:51, 28 January 2023Thumbnail for version as of 09:51, 28 January 20231,871 × 576 (208 KB)Mekkiwik (talk | contribs)Suite à une modification globale de ces diagrammes, je les publie regroupés par clade et non génome par génome.
17:20, 15 December 2021Thumbnail for version as of 17:20, 15 December 20211,318 × 807 (162 KB)Mekkiwik (talk | contribs)suppression du diagramme blo x+ 31-400, inutile
20:51, 11 December 2021Thumbnail for version as of 20:51, 11 December 20211,309 × 811 (189 KB)Mekkiwik (talk | contribs){{Information |Description=Projet de recherche: Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes. L'étude des intercalaires cds..cds permet de les comparer aux intercalaires cds..RNA et RNA..RNA. Les diagrammes des fréquences des intercalaires cds..cds positifs, continus et discontinus de 1 à 400 pbs et de 31 à 400, sont présentés ici pour montrer la grande différence entre continus et discontinus. Les abscisses...

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